Trung tâm Y tế Đặc khu Côn Đảo là đơn vị y tế hạng III, trực thuộc Sở Y tế Thành phố Hồ Chí Minh, được xếp loại theo quy định của Bộ Y tế về phân tuyến kỹ thuật và xếp hạng cơ sở khám bệnh, chữa bệnh công lập.

Trung tâm đảm nhiệm chức năng của một bệnh viện đa khoa tuyến huyện, đồng thời quản lý hai Trạm Y tế trực thuộc là Trạm Y tế Cỏ Ống và Trạm Y tế Bến Đầm.

Về chuyên môn, Trung tâm Y tế Đặc khu Côn Đảo:

• Triển khai đầy đủ các kỹ thuật chuyên môn tuyến huyện, bao gồm cấp cứu, khám bệnh, điều trị nội – ngoại – sản – nhi, y học cổ truyền, xét nghiệm, chẩn đoán hình ảnh, dược và kiểm soát nhiễm khuẩn.

• Thực hiện các chương trình y tế quốc gia, công tác phòng chống dịch bệnh, chăm sóc sức khỏe ban đầu và quản lý sức khỏe toàn dân trên địa bàn.

• Hợp tác chuyên môn chặt chẽ với các bệnh viện lớn tại TP. Hồ Chí Minh như Bệnh viện Nhân Dân 115, Bệnh viện Nguyễn Tri Phương, Bệnh viện Hùng Vương, Bệnh viện Chấn Thương Chỉnh Hình... nhằm tăng cường năng lực khám chữa bệnh, hội chẩn chuyên khoa, chuyển giao kỹ thuật và đào tạo liên tục cho đội ngũ y bác sĩ tại đảo.

• Hàng tháng, Trung tâm đón tiếp các đoàn bác sĩ chuyên khoa từ các bệnh viện tuyến trên TP. Hồ Chí Minh ra công tác tại Côn Đảo để hỗ trợ chuyên môn, khám sàng lọc, phẫu thuật nhỏ và tư vấn sức khỏe cho người dân.

• Đảm bảo công tác sơ cấp cứu, khám chữa bệnh cho cư dân, lực lượng chức năng và du khách, đóng vai trò là tuyến điều trị cuối cùng tại địa phương.

Với đặc thù là cơ sở y tế duy nhất trên đảo, Trung tâm Y tế Đặc khu Côn Đảo không chỉ là nơi chăm sóc sức khỏe cho người dân, mà còn là bệnh viện tuyến đầu của vùng biển đảo phía Nam, góp phần khẳng định vai trò chiến lược của ngành y tế TP. Hồ Chí Minh trong việc chăm sóc sức khỏe nhân dân vùng hải đảo.